如何建设好中国特色新型智库，是与会专家最为关注的重点。国防大学教授、国家安全实验室秘书长欧阳维从党管智库和保持智库独立性方面进行了详细分析：“党管智库，就是要坚持正确发展方向，要有科学规划、合理布局。保持独立性，就是要成为瞭望者、谋划者、监督者，要有担当精神。党管智库与保持独立性并行不悖。”

　　新加坡国立大学亚洲与全球化研究所所长黄靖就智库管理指出：“好的智库往往有两个董事会。一个把握学术方向，另一个负责筹款。通过这种管理方式，可以保障研究的独立性、客观性，帮助智库保持活力。”

　　“旋转门”制度一直是美国智库最为人称道的机制之一，但是这一制度在中国是否适用？清华大学公共管理学院教授朱旭峰进行了深入研究：“旋转门对中国智库的发展作用不大，甚至可能会有反作用。在控制其他因素的情况下，经过‘旋转’的人员对提升智库影响力、增加智库经费、扩大社交网络均无显著贡献。”

　　中国浦东干部学院科研部副主任王友明提出，智库之间要处理好竞争与合作的关系，利用团队合作、联合攻关模式，集中力量办大事。鼓励合作的同时，也要鼓励竞争。应当建立保障公平的体制机制。

　　上海财经大学副校长蒋传海针对高校智库建设表示：“高校智库应开拓与决策部门对接的渠道，开展针对性研究；探索灵活的用人机制；着力提高高校智库研究成果的影响力；注重差异化发展，凸显专业性、行业性、综合性。”